食品的安全、衛生、品質，皆為消費者、食品業者與中央主管機關相當注意的重要議題，因此，本團隊乃針對上述相關食品安全、衛生、品質之重要微生物，如食品病原菌-沙門氏菌、金黃色葡萄球菌、病原性大腸桿菌、李斯特菌、阪崎腸桿菌、腸炎弧菌、無乳鏈球菌、仙人掌桿菌屬；食品品質劣變腐敗菌-乳酸菌群、螢光假單孢菌；另包括保健食品益生菌-乳酸短桿菌屬、雙叉桿菌屬等，加以設計具高特異性與高靈敏度之PCR引子組、DNA探針、生物晶片與即時定量PCR等檢測方法。技術原理:細菌檢測用的生物晶片，即利用晶片上每一菌種具有專一性的DNA片段，作為探針，亦作為不同菌種鑑定及檢測之用。而DNA序列的差異可分為不同等級，利用不同等級的差異可鑑定出分屬不同科、屬、種的菌株。每一種細菌在晶片上具有不同的DNA 雜交圖譜，藉由不同的雜交圖譜，來鑑定不同的病原菌。創新性:本研究團隊所設計之生物晶片方法乃是以一條共通性引子組，放大出特異性的基因卡匣，與晶片上佈放之多條特異性探針，進行雜交後，可以檢測許多重要的食品病原菌、污染菌與造成腐敗的微生物群等。應用範疇:應用目標為病原菌以及益生菌之快速定性、定量檢測工作。應用範圍包括：食品及食品加工廠、進出口食品檢驗、家畜防疫檢驗機構、政府單位例行食品衛生檢驗工作、供膳之營業場所、醫院內感染的控制與監測、生技產品管控、啤酒廠、乳品廠、酪農、畜牧業等。