學研新創 - 創新防疫科技
AI老藥新用平台發現超越瑞德西韋的多效型新冠解方
2021-12-23
楊進木教授團隊/國立陽明交通大學

楊進木、Nikhil Pathak、陳筠媞、許彥超、許農育、羅永淳、李容羽、陳宜群、楊欣儒、黃宇薇

世界急需新冠病毒(COVID-19)之藥物開發,本團隊透過人工智慧及大數據方法建立AI老藥新用平台,除具商業潛力,三個月內發現JMY206比瑞德西韋好數十倍(細胞實驗)的FDA舊藥,此結果國防預醫所驗證,部分成果已發表在國際頂尖期刊ACS Nano [IF: 15.881]。
本團隊以計算藥物設計及計算系統生物為核心,結合人工智慧、大數據、化學、統計、生物與臨床醫學的跨域合作,開發AI老藥新用平台應用於新冠病毒,以大量SARS-CoV、MERS及跨物種的冠狀病毒3CL蛋白酶-配體複合物結構,比對全球超過250份結構,發現SARS-CoV-2之活性部位的六種彈性結構及其藥效團簇(PPC: protease pharmacophore clusters),將此作為2,122 種FDA老藥的篩選模板,發現Boceprevir、Telaprevir、Nelfinavir能抑制蛋白酶活性(由中研院驗證),在細胞實驗上證實有效 (由台大及國防預醫所驗證),這些結果顯示本平台找到蛋白酶活性位點的重要動態結合機制藥物篩選。同時另一個JMY206細胞實驗降低病毒能力比瑞德西韋強數十倍之FDA老藥且為多功效抗新冠藥,可同時阻擋新冠入侵、抑制新冠複製及降低免疫風暴;在動物實驗上,JMY206抑制新冠病毒、減緩肺部病徵、降低免疫風暴上比瑞德西韋好,是具臨床價值的口服藥物。已專利佈局二項美國臨時專利、因應全球疫情規劃將此舊藥申請進入臨床、有形市場極大、無形利益(挽救生命、安定人心)無限,是極具臨床價值的口服藥物。

評審推薦
1. 此平台找到蛋白酶活性位點的重要動態結合機制進行藥物篩選。同時更發現另一個 JMY206 細胞實驗降低病毒能力比瑞德西韋強數十倍之 FDA 老藥且為多功效抗新冠藥,可同時阻擋新冠入侵、抑制新冠複製及降低免疫風暴。
2. 本研究已提供細胞和動物實驗數據,並建立其抗發炎作用機轉。
2023年度精進成果
老藥新用在面對緊急疾病具縮短開發時程之優勢,但目前老藥新用計算平台缺乏整合系統結構生物與藥物機制的能力。本團隊在第18屆國家新創獎中,成功建立AI老藥新用平台,發現FDA舊藥JMY206 (methotrexate, MTX) 比瑞德西韋好數十倍。獲獎迄今,我們持續精進平台的核心技術,解析MTX在治療COVID-19的藥效機制,成果發表於Frontiers in Immunology。我們也應用此平台發現了兩個FDA老藥,能有效治療由空氣微粒引發的肺部發炎及藥效機制,發表於高影響力期刊Environment International (2023)。我們也精進JMY206的專利佈局及臨床驗證,已經獲得美國(US20220288080A1)及中華民國(I815341)的發明專利。在臨床驗證上,陽明交通附屬醫院和北市聯合醫院已核准JMY206的人體臨床計畫,已有數名受試者參與,正在進行藥效評估。相信本平台能加速精準醫療及JMY206進入市場。
團隊簡介
楊進木
學歷 國立台灣大學 資訊工程系 博士
現職 國立陽明交通大學 生物科技學院 院長
經歷

i. 國立陽明交通大學 生物科技學院 院長 2021/02-now
ii. 國立交通大學 生物科技學院 院長 2020/02-2021/02
iii. 國立陽明交通大學 生物資訊及系統生物研究所 教授 2021/02-now
iv. 國立交通大學 生物資訊及系統生物研究所 教授 2007/8-2021/02
v. 獲得中國工程師學會 - 傑出工程教授獎2020
vi. 獲得第三十屆王民寧獎- 藥學類傑出貢獻獎(唯一藥學類得獎者) 2020
vii. 獲得獲第十九屆有庠科技講座- 生技醫藥類(唯一得獎者) 2020

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