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實驗室研究成果數位智慧化:雲端共享架構的實驗室電子記事本
2018-12-12
林仲彥副研究員團隊/中央研究院資訊科學研究所

陳淑華、黃智偉、林仲彥

本系統為目前全球唯一提供多種平台的泛用型電子實驗紀錄平台,可因應不同領域、實驗規模及有隱私資料考量的研究團隊使用,可真正落實實驗室研發之智慧成果數位化與自有化,大幅減低隱密資料外漏與備份損毀之疑慮,並依目前新世代實驗室數據數位化的現況,開發全新的搜尋、紀錄、分享等功能,相較目前商用電子記錄本與其他按使用人數收費的線上平台,往往針對特定用途來設計,使用相當不便。然而本系統擁有更為直覺的使用介面、更為簡單的安裝維護、個人實驗資料的保護、研究計畫參與使用者權限控管與備份復原等機制,並能支援多種平台多種語言,能因應包括手機與平版等多種移動式設備的連結使用。此外,本系統也可搭配網路儲存設備,自動備份,並可快速重建,增加資料安全性,因以開放源碼為主體,程式安全透明,無須像一般商用電子記錄本需額外付費購置高價資料庫、套裝軟體與設備維護成本。同時,本系統亦首建實驗室藥品耗材管理與查詢系統 (QR code),可即時瞭解特定藥品或物品的相關資訊,並具有實驗記錄認證機制與修改紀錄管理,亦能加入第三方認證機制,確保資料的公正性,減少日後發生違反研究倫理的潛在可能。透過實驗記錄的電子化,以我們所設計資料重新串接之功能模組,可將長期累積的實驗記錄去蕪存菁加以整合,除了可以持續累積研究的智慧成果外,也將可減低人員流動對實驗室的技術與研究所造成的衝擊。

評審推薦
1.本項產品利用公開軟體,設計雲端共享工作紀錄簿,並具有8年的實際運作實績,對於龐大的醫療生技資料電子化處理,有一定的市場需求度。
2.目前UI設計適合生醫專業人員操作,並且匯聚完整的實驗工具,具實用性與擴增性。
2022年度精進成果
1. 研究成果已於今年八月發表在國際高影響力期刊iScience 2022,並提供線上文件與展示網站,供全球研究社群使用。
2. 本年度特別強化資安架構,透過MySQL資料庫密碼的自訂與安全通訊端層憑證(Secure Sockets Layer)的建置,將可避免未來可能的惡意攻擊與資料外洩。
3. 透過重新設計的使用者介面,並加強文字檢索、內文編輯與行事曆的功能,且針對於不同電子手持裝置與平台進行使用介面的優化,讓整體使用互動更為直覺。
4. 改善使用者管理與計畫參與權限的控管機制,使團隊責權更加分明,網站管理者可以新增並分配管理員權限,有助於團隊分工同時亦屏蔽惡意程式碼的上傳。
5. 本平台已於Github網站建立專案,同時也在DockerHub上公開映像檔,目前共有467次來自全球的下載次數,將在國內外學術會議持續進行相關的宣傳,並不定期舉辦工作坊,來提昇此一研究成果國內外的能見度。
團隊簡介
林仲彥
學歷 博士
現職 研究員
經歷

1. Joint-appointed Associate Research Fellow, National Health Research Institutes, Institute of Population Health Sciences, Taiwan (2012/1–present)
2. Invited Visiting Scholar, National Institute of Advanced Industrial Science and Technology, Computational Biology Research Center, Japan (2011/9–2012/7)
3. Associate Research Fellow, Academia Sinica, Institute of Information Science, Taiwan (2011/3–present)
4. Visiting Scholar , Molecular & Medical Phamacology , David Geffen School of Medicine at UCLA, United States (2010/8–2011/1)
5. Joint-appointed Assistant Principle Investigator, National Health Research Institutes, Division of Biostatistics and Bioinformatics, Taiwan (2005/11–2011/12)
6. Assistant Research Fellow, Academia Sinica, Institute of Information Science, Taiwan (2005/10–2011/1)
7. Joint-appointed Assistant Professor , National Taiwan University, College of Life Science, Taiwan (2005/2–present)
8. Assistant Investigator, National Health Research Institutes, Division of Biostatistics and Bioinformatics, Taiwan (2004/1–2005/10)
9. Postdoctoral Fellow, National Health Research Institutes, Division of Biostatistics and Bioinformatics, Taiwan (1999/10–2003/10)
10. Founder, Yam Navigator (http://www.yam.com), Taiwan (1997/6–present)

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